Из-за увеличения количества пользователей Единой карты петербуржца их владельцы переживают за сохранность личной информации. На Горячую линию компании поступают звонки, большая часть относится к этой проблеме. В центре сопровождения программы поясняют, что данные держателей находятся под защитой.
Единая карточка петербуржца представляет собой независимые между собой цифровые приложения. К ним относятся такие приложения: банковские и транспортные, а также для идентификации и аутентификации пользователей. Дает возможность для записи электронной подписи. Информация, хранящаяся в каждой системе, защищена по отдельному принципу.
Выпуск ЕКП происходит с соблюдением необходимых технологий и требований. Производство запущено на соответствующей технике. Их изготавливают на заводе в России, такая карточка является банковским товаром. Массовое производство и выпуск карточек происходит по заданным стандартам. Данные их владельцев защищены в соответствии с международными требованиями по безопасности платежных карт. Помимо этого оператором данного проекта разработаны отдельные методы по защите личных данных.
Сведения, размещенные на ЕКП, находятся в аттестованной государственной информационной системе. Обмен информацией между транспортными, медицинскими и другими системами реализуется по закрытым линиям связи. Сведения сохраняются в безопасности. При утере ЕКП процесс блокировки такой же, как и для пластика любого банка.